呼和浩特市地方海事局成立于 2004 年 9 月 , 由原市港航监督处更名为呼和浩特市地方海事局。主要职责为执行国家水上交通安全法律和自治区港监、船检等水上安全规章制度，按国家有关船舶登记、检验规定办理船舶登记、检验等业务，负责调查处理水上交通安全，审查有关水上交通安全事故，协调有关部门执行国家有关船舶、渡口、湖泊、水库防污染法规，配合相关部门对水上交通安全事故组织抢救等工作。海事局编制 15 人，在编人数 14 人，下设业务和综合两个科室，验船师两人。
    我市管辖水域 144 平方公里、黄河 106.84 公里 ，辖区总面积 178.5 平方公里。渡口 9 个，其中托克托县 6 个，清水河县 3 个。
     在我局注册登记的船舶 45 艘，其中托可托县 8 艘，渡船 2 艘，游船 6 艘，清水河县 16 艘，其中渡船 3 艘，驳船 10 艘，拖轮 2 艘，快艇 1 艘，土左旗哈素海游船 19 艘，其中快艇 17 艘。
    由于我市属非水网地区，冰冻期长，航道通航能力差，没有长航运输，只有少量的渡运船舶和季节性的旅游船舶，船舶类型也主要是小型挂浆机船，整体水平还很落后。